在印尼雅加達,真菌學教授伊布·拉特納接到警察局的傳喚。當他得知本地一家麵粉穀物工廠發生了感染爆發事件時,他的心中已經預感到一絲不祥。迅速趕到了現場,並在解剖了一具被真菌感染致死的遺體後,他的擔憂變成了恐懼。
這位久經沙場的真菌學家深知,這次爆發的感染並非尋常疾病。在顯微鏡下,那些曾經熟悉無害的真菌如今已經變得猙獰可隘,它們以驚人的速度繁殖,侵蝕著每一個生命體。伊布知道,如果不盡快採取行動,整個城市,甚至整個國家都可能陷入這場災難。
他提出了一個大膽而極端的建議——轟炸城市。儘管這聽起來近乎瘋狂,但伊布堅信這是阻止感染擴散的唯一方法。然而,政府並沒有採納他的建議,他們擔心這樣做會造成更大的傷亡和混亂。
另一邊,喬爾和泰絲正陪伴著一位看似平凡卻隱藏著巨大秘密的少女──艾莉。她感染了這種真菌,卻奇蹟般地沒有症狀。他們被告知,艾莉的身體裡蘊含著對抗這種真菌的免疫力,她是研發疫苗的關鍵。然而,喬爾對這個說法持懷疑態度。
三人穿越被感染者佔據的城市,朝著議會大廈前進。他們的目的地是火螢組織,一個致力於尋找解決方案的秘密組織。但是,當他們到達大廈時,卻發現所有的火螢成員都已經喪生,其中一人甚至因為感染而變得瘋狂,引發了同伴間的自相殘殺。
泰絲在絕望中透露了自己也被感染的消息,而艾莉的傷口卻開始癒合,這證明了她確實具有免疫力。喬爾不得不面對現實,他開槍殺死了一名已經變成感染者的火螢成員,但他不慎觸發了真菌纖維,引發了更大的混亂。
泰絲明白,他們已經沒有退路。她決定犧牲自己,為喬爾和艾莉爭取逃脫的時間。她建議喬爾帶著艾莉去找他們共同的老熟人,也許那裡還有一線生機。
當喬爾和艾莉離開時,泰絲將整個大廳倒滿了汽油。當感染者們破門而入時,她引燃了汽油,與那些可謙的生物一同消失在火海中。
喬爾帶著艾莉繼續前行,他們的目的地越來越近。