抗日戰爭時期,日軍為順利佔據長沙,啟用潛伏在中國15年的戰略特工“黑執事”,實施策劃已久的戰略欺騙計劃。地下黨黨員雲慕之在調查「黑執事」的過程中被殺。不知道父親真實身分的雲弘深為追查殺父兇手,回到家鄉長沙,隨即被捲進「黑執事」早已部下的陷阱之中。正當他迷茫無助之時,父親生前好友,地下黨黨員楊梓銘給了他極大幫助和保護,他終於識破對手騙局。在gong產黨的領導下,雲弘深與愛國青年聞夜鳴聯手,局中設局,步步為營,在國恨面前放下家仇,將自己設為死棋,挖出了深藏在國軍內部潛伏的日本戰略特工,扭轉了戰局,為第一次長沙會戰的勝利做出了極大的貢獻。
雲弘深根據線索發現被擊殺的只是曲文摯的替身,真正的曲文摯已經被秘密轉移到酒坊,雲弘深根據留下的線索,一路追查到酒坊,潛入調查中,遇到了前來刺殺曲文摯的聞夜鳴,雙方都誤認為對方是敵人,兩人一番打鬥,爭搶手槍時不慎走火,響動被保鏢們聽到,保鏢讓曲文摯留在房內,自己出去檢查狀況。這時,長沙站軍統特務李良也潛入酒坊,與保鑣發生槍戰,並闖入曲文摯藏身的房間內,卻發現曲文摯已不知去向。此時日本憲兵隊趕到了這裡,聞夜鳴與雲弘深也無心糾纏,李良與聞夜鳴碰面後撤離了酒坊,雲弘深與兩名助手也撤離了此地。雲弘深回家後,發現父親雲慕之正把法蘭西銀行的金磚兌換成日本中儲會發行的儲備券,雲弘深氣憤上前,大吵大鬧,被雲慕之訓斥。雲家父子兩人回到書房後,又是一番爭吵,雲弘深誤認為父親是在為法國人蒐集情報,開始懷疑父親的真實身份,父親告知雲弘深因為他的魯莽行為,導致兩人身分暴漏給了子爵。雲弘深不相信自己失誤導致暴露,卻被雲慕之指出漏洞所在,雲弘深無言以對。雲慕之決定在晚上的酒會收網除掉子爵。
上海飯店答謝會上,「子爵」設局欲毒殺雲慕之,雲家父子察覺後將計就計,雙方各自出手,雲慕之假意中招,實施了中毒後心臟病去世的假死計劃。子爵誤以為已經殺掉了雲慕之,並抓住了雲弘深,放鬆警惕,結果沒想到一步步落入了雲慕之的計劃之中,雲弘深順勢找到了子爵藏身的老巢,並成功擊殺了“子爵”,搜出一把鑰匙。同時,軍統特務聞夜鳴也收到了程惠澤的命令,前往上海飯店刺殺曲文摯,聞夜鳴有勇有謀,成功找到了曲文摯並將其擊殺,並一把火燒掉了曲文摯的所有物品。原來早在之前,曲文摯就與“子爵”見過面並將情報交給了“子爵”,“子爵”已經把長沙布防的情報交回到日軍作戰司令部。雲慕之假死示人,安排雲弘深配合他演戲,以便雲慕之進入組織安排的休眠狀態。得到了情報的第十一軍司令官岡村寧次正在安排進攻長沙的作戰計劃,可是他們的作 戰計劃竟然被人竊取,並交到了上海最神秘的情報販子八哥的手中。此時,岡村寧次也收到昆吾的電報,識破雲慕之有可能詐死,遂派人監視雲弘深。
雲弘深和聞夜鳴都趕往與八哥會面的茶樓,殊不知他們都掉進了「昆吾」設計好的陷阱。雲慕之的計畫被打亂,他擔心雲弘深安危,也為了向組織傳遞情報,前往茶樓,卻被日軍安排的狙擊手擊中,雲慕之拼著最後一口氣將雲弘深救走,並向組織傳遞了八哥情報有詐的消息。雲慕之在彌留之際告訴雲弘深不要傷心,要繼承他的遺志,並說他身分的秘密確實是在地下室。雲慕之的離世讓雲弘深十分悲痛又自責。雲弘深根據父親留下的遺言,找到了與雲慕之組織聯絡的暗號:「半張照片」。雲慕之把銀行用來兌換日本儲備券的金磚換成鉛塊的事情暴露,日本憲兵隊抓走了所有與此事相關的人員。因為雲慕之已死,憲兵隊抓走了雲弘深調查。雲弘深也知道父親偷換黃金的事情,意識到自己錯怪了父親,感到深深的自責。雲弘深把目標鎖在了昆吾身上,但還是被日本憲兵抓住。國民黨特務同時也在計畫除掉可能從雲慕之那裡繼承太多秘密的雲弘深。雲弘深在與日本人的交鋒中進一步清楚父親與侵略者的敵對關係,心中對日本人更加憎恨,也對父親的死更加悔恨。
雲弘深用假證件設計戲耍了日本憲兵隊,從家中拿回了“半張照片”和父親的骨灰,他計劃回到長沙,追查聞夜鳴,查出“昆吾”,為父親報仇。長沙受到日本空軍的轟炸,「雲家大少」雲弘祈擔心湘江女中的女學生安危,前往查看,遇到了在給一位受重傷女學生搶救的護士米蘭,兩人合力救援,卻還是沒能救回女學生的性命。雲弘祈被米蘭的善良和真誠打動,對米蘭產生了好感。雲弘深回到長沙,發現自己被人跟踪,原來是長沙商會宗方安排白門的人追查雲弘深。宗方得知了雲弘深擊殺“子爵”,認定雲弘深是個危險人物,意欲殺掉雲弘深。雲弘深在米蘭的幫助下,成功擺脫了跟蹤的白門眾人,雲弘深也透過米蘭知道了追自己的是白門的人。經米蘭幫助雲弘深躲進了傷兵醫院。雲弘祈的跟班小刀發現了白門的人在火車站找人,告訴了雲弘祈,雲弘祈透過白門蒐集七八年前女中15週年報的線索,推測白門要找的人可能是雲弘深。
凌寒知道雲弘深在軍統站附近監視,故意出門,讓雲弘深跟蹤自己,但他們的行踪暴露,宗方在雲弘深經過的路上設下陷阱,安排殺手川島狙擊雲弘深。雲弘深發現不對勁,趕緊撤離,可還是受傷,兩人發生槍戰。而這時,在附近巡邏的警察唐隊長也趕往探查,川島跟雲弘深發現警察來了,雙雙撤離。從白門手中救下米蘭的雲弘祈剛好在附近,透過自己在警局的內線小黃的指引,找到了逃跑中的雲弘深。兄弟相逢,求證父親的情況,雲弘深支支吾吾不肯說實話,雲弘祈隱隱感覺到不對勁,懷疑父親出事了,逼問雲弘深。雲弘深想到父親死亡時的場景,差點犯病暈倒。雲弘祈終於妥協,不再追問,卻還是強行把雲弘深帶回家中。凌寒找到了殺手留下的子彈,並根據現場推測出有人監視自己的行踪,導致跟踪自己的雲弘深被埋伏,他讓聞夜鳴將一路上的各個小販抓起來審問。雲弘深回到家,奶奶雲老太太非常開心,吩咐驚雨做了雲弘深愛吃的菜,詢問雲弘深關於雲父的狀況。雲弘深隱瞞雲慕之犧牲的事情,說父親出國考察。雲老太太也懷疑雲父出事,表面不露聲色,心底暗暗傷心。
聞夜鳴回到軍統後下令秘密監視雲弘深、雲弘祈,而凌寒此刻追查軍統站內姦也有了一點眉目。雲弘深和雲弘祈發現家裡已經被軍統人員監視,悄悄潛回家中,雲弘深不小心說漏嘴,讓雲弘祈得知了雲慕之犧牲的消息。雲弘祈要去殺了聞夜鳴為雲父報仇,卻被雲弘深攔住。雲弘深告訴雲弘祈要以大局為重,八哥手中很可能有日軍進攻長沙佈局的情報,要先找到八哥,拿到情報,再追查聞夜鳴和「昆吾」。雲弘祈吩咐小刀調查八哥行蹤,請朋友許年也幫忙打聽。聞夜鳴向柯靖平報告抓捕情況,凌寒向柯靖平匯報查到了曲文擎的逃跑路線,發現曲文摯逃跑和白門有關,並根據軍統死亡的清潔工,縮小了軍統內奸的範圍。同時聞夜鳴也從副手陳東萍的報告中得知李學敏已死。
聞夜鳴覺得李學敏的死有蹊蹺,帶隊去傷病醫院調查。雲弘深和雲弘祈暫時不能回雲家,就準備去傷兵醫院暫住幾日。他們混在傷兵中,藏身到傷兵醫院,剛巧看到了聞夜鳴正在審問米蘭,米蘭的回答讓聞夜鳴對她產生懷疑,聞夜鳴讓副手陳東萍在醫院找線人監視米蘭。雲弘深看到滿身是血的傷員,又犯病暈倒了。在米蘭的幫助下,雲弘深、雲弘祈順利地留在了醫院,隱藏了他們的身份。米蘭的熱心讓雲弘深更加生疑,雲弘深讓雲弘祈幫忙調查米蘭。唐隊長向楊梓銘說了軍統正在追查雲弘深和雲弘祈的事情,楊梓銘讓唐隊長盡快找到他們。楊梓銘推測八哥手中的情報關乎日軍攻擊長沙的襲擊方向,他要求暗中保護兄弟二人。唐隊長查到了他們暫時落腳傷病醫院。雲弘深在醫院思考尋找八哥的方法。米蘭趕來,藉由病情詢問雲弘深父親的事。米蘭聊到父親背上有一塊被燒傷的疤痕,而八哥的背上,剛好就有這樣一塊疤痕。
雲弘深、雲弘祈趕忙趕往八哥住宿的賓館,卻在咖啡館門口被警察認出,警察通知了聞夜鳴,聞夜鳴也趕到了咖啡館,並發現了死亡的八哥,懷疑是雲弘深殺害了八哥。楊梓銘此時迫切想要見到雲弘深,他前往雲家探望,卻發現雲家被軍統特工秘密監視,楊梓銘去到軍統站,要求柯靖平取消對雲家的監視。雲弘深和雲弘祈趕到賓館,發現賓館已經被人搜過了,那人帶走了一本書,雲弘祈、雲弘深仔細搜查住所,終於發現了八哥隱藏的密碼本,但是密匙卻被川島和宗方得到。經過搜查,雲弘深和雲弘祈發現八哥竟然是米蘭的父親,雲弘深對米蘭的身份產生懷疑。雲弘深、雲弘祈回到醫院找米蘭,雲弘祈擔心米蘭得知父親過世承受不住打擊,沒有告知她這件事情,雲弘深卻在一點點試探米蘭,米蘭回答得滴水不漏。傷病醫院已經被軍統監視,雲弘祈和雲弘深無處可去,米蘭留他們在自己家中暫住。
川島剛看見雲弘深、雲弘祈,就知道自己上當了,一路逃竄。雲弘深、雲弘祈奮起直追,終於堵住了川島,川島以一敵二,落入下風。此刻一婦女經過,川島趁機劫持了人質,雲弘深擔心人質安危,不敢上前,最終救下人質,卻被川島逃走。雲慕之的「頭七」到了,雲弘深帶著雲弘祈前往麓山寺祭拜,他們在麓山寺見到了楊梓銘,雲弘深和楊梓銘密談,得知楊梓銘是父親的戰友,也猜出了父親的真實身分是地下黨。他將上海發生的事情告訴了楊梓銘,楊梓銘認為聞夜鳴應該不是殺害雲慕之的兇手,很有可能是「昆吾」設計把嫌疑栽贓到聞夜鳴頭上。雲弘深仔細思索後,也發現很多疑點。楊梓銘讓雲弘深去一個地方,雲弘深和雲弘祈在這裡看到了聞夜鳴對收容所孤兒的關心與疼愛,改變了對聞夜鳴的看法,並且計劃與軍統聯手,一起查找日本間諜拿走的情報金鑰。雲弘深打電話聯絡聞夜鳴,告訴她殺害八哥的其實另有其人,希望和解,一起追查殺害八哥的兇手。
雲家兄弟帶米蘭去看父親的屍體,雲弘深繼續靜靜地觀察米蘭。雲家兄弟晚上借宿在楊梓銘家,雲弘深藉機向楊梓銘詢問昆吾的情況,此時楊梓銘也正式向組織申請對昆吾和八哥情報的調查工作,代號「天網行動」。雲弘深和楊梓銘推測出軍統內部有日本臥底,雲弘深提議自己加入軍統,跟軍統聯手,查出軍統內部的臥底,再順藤摸瓜查出殺害八哥的兇手和“昆吾”,找回密鑰。但雲弘深在破解密碼時遇到了困境。聞夜鳴為了調查八哥死因,到醫院帶走了米蘭,剛好被雲弘深碰到。雲弘祈知道米蘭被抓後非常著急,雲弘祈根本不信米蘭有任何嫌疑。雲弘深想從米蘭打聽八哥的一些生活習慣,方便其破獲密碼本,就前往醫院找米蘭,正好看到米蘭被聞夜鳴帶走。雲弘祈得知後十分著急,想要去救米蘭,雲弘深攔住雲弘祈,他想藉軍統之手核實米蘭的身份。兄弟兩人為此爭論,雲弘深以兩小時為限,讓軍統調查米蘭,兩小時一到,就前去救援。在軍統站,米蘭不肯交代,企圖用額頭撞擊桌角自殺,聞夜鳴不為所動。
雲弘深沒有從行李箱中獲得有用線索,就和雲弘祈一起把箱子送回給米蘭,想詢問一些細節。然而父親的死對米蘭打擊很大,雲弘祈在旁安慰,米蘭不經意間透漏出父親的一些生活細節,給雲弘深破解密碼本帶來了啟發。米蘭鄭重拜託雲家兄弟幫忙尋找兇手,雲家兄弟離去後,米蘭的表情又富有深意的變化了。宗方命令自己在軍統安插的內線,趁著今晚雲弘深、雲弘祈參加慈善晚會,偷偷前往雲家,尋找密碼本,卻被雲弘深識破,提前安排雲老太太和驚雨暫住楊梓銘家中,並與聞夜鳴商量,派遣軍統特工提前在雲家做好埋伏。雲弘深和聞夜鳴在晚會上發現了有十多個人都抽賓治雪茄,無奈只能從雪茄源頭去查找,看看能有什麼線索,而此時他們收到消息,在雲家埋伏的行動失敗了,他們立刻離場,意外地看到了殺害八哥的川島。雲弘深和聞夜鳴立刻追擊,一番戰鬥,雲弘深為了救了聞夜鳴,讓川島逃脫。他們趕到雲家,軍統的特工都被殺害,根據現場情況,他們推測出兇手是軍統內部人員,並且在交戰中左腿中槍,但檢查過軍統所有那特工的腿,發現沒有人受傷。
雲弘祈擔心自己一人去查貨廊會被懷疑,就找米蘭一起去查探,順便讓米蘭散散心。在這家店鋪,雲弘祈查到了李妙涵購買過大量的賓治雪茄。雲弘祈想在這家店挑一件禮物送給米蘭,但米蘭卻不開心的走了出去,她告訴雲弘祈,看著這裡物品的昂貴價格,夠買好些藥品,可以救好多受傷的士兵,這裡的奢侈享受讓她很不舒服,雲弘祈為了賠罪,親自當黃包車夫,拉黃包車送米蘭回家,並告訴了米蘭自己的身世,原來雲弘祈是雲家的養子,並不是雲弘深的親哥哥。米蘭回到家中,故意透露給軍統自己有八哥遺物的消息,引來聞夜鳴,又聯繫雲弘深幫忙,一起去領回父親八哥的屍體,聞夜鳴和雲弘深先後趕來米蘭家,聞夜鳴要帶走八哥的遺物,雲弘深阻攔,與聞夜鳴大打出手,兩人關係鬧僵,米蘭姦計得逞,聞夜鳴走後,米蘭又設計引導雲弘深破解密碼本。雲弘深透過米蘭引導,有了一絲靈感,趕緊回家破解,雲弘深解密八哥的密碼本,終於找對了方式。
雲弘祈讓警察小黃幫忙偷出八哥屍體的事情敗露,聞夜鳴帶隊來雲家逮捕雲弘祈,將雲弘祈抓進了軍統監獄,雲弘深為了救雲弘祈,前來與柯靖平談判,柯靖想要與雲弘深合作,讓雲弘深交出密碼本,並加入軍統,結果兩人未談妥,但這一切已經在雲弘深和楊梓銘既定的計策上發展了。凌寒檢查靳國強的屍體,發現了幾處人為傷害的疑點,懷疑這是一次人為性質的車禍,將查詢推測的情況向柯靖平匯報,他提出了讓雲弘深交出密碼本,勾引軍統內奸的出現,趁機抓內姦的想法,柯靖平擔心雲弘深不配合,凌寒想出了一計能讓雲弘深同意加入軍統,並交出情報。原來經過凌寒下線的慫恿,白慶奎想要綁架雲老太太,柯靖平就安排聞夜鳴在白門的人實施綁架時救出雲老太太,並告訴雲弘深,他不交出密碼本,他的家人就不得安寧,雲弘深為了家人的安全,同意加入軍統,並交出密碼本,但他要求軍統放了雲弘祈,並且通過密碼本勾引內鬼的具體執行計劃由他來製定。雲弘深加入軍統,將破解的密碼向重慶方面發電報,順利騙出了藏在軍統對面樓的內鬼,雲弘深發現後第一時間報告柯靖平。
軍統特工趕到時,旁邊樓上已經人去樓空。雲弘深又設計讓第九軍區長官前來取密碼本的假象,李良趁機製造混亂,前來偷密碼本。李良被埋伏好的凌寒抓獲,凌寒審訊李良,李良交代說一切都是受到副站長朱賀的指使。雲弘深和聞夜鳴前往李良家搜索,查到了李良向外傳遞情報的證據,李良矢口否認,並認定是受到朱賀的指使,但是卻並沒證據可以證明,最終李良被朱賀槍斃。當晚,米蘭與宗方密談,李良的死亡,讓宗方確定了雲弘深已經破解了八哥密碼本的暗語,並且密碼本還在雲弘深的手中,米蘭警告宗方,不讓他對雲弘深動手。雲弘深回到家中,與雲弘祈就加入軍統的事情發生了爭吵,雲弘祈恨自己沒能幫上忙,還害得雲弘深為了救自己加入了軍統,擔心雲弘深的安危,讓雲弘深離開軍統,雲弘深卻想藉軍統的手,查出“昆吾”,找的密匙,不同意離開軍統,兩人不歡而散。雲弘深來到軍統檔案室,調查李良的檔案,發現李良的檔案竟然被人查探過,原來在他來之前,朱賀也來調查了李良的檔案。
在軍統長沙站的情報會上,朱賀此時讓雲弘深交出密碼本,雲弘深不從,柯靖平假意關雲弘深禁閉,讓雲弘深去往培訓基地做短期培訓,其實是讓雲弘深查出軍事基地的內鬼。雲老太太開導雲弘祈,讓他不必再自責,並且有意撮合雲弘祈和米蘭,讓雲弘祈去接米蘭來家裡吃飯,米蘭趁機潛入到雲弘深的房間,並查探到雲弘深已經解開密碼本的暗語。雲弘深和聞夜鳴來到了訓練基地,雲弘深一來就受到了訓練基地總教官章華給他的下馬威。當晚,雲弘深和聞夜鳴決定先摸摸底,晚上他們出來碰面時,發現被人跟踪,經過一番打鬥, 兩人為逃避追捕躲進了密室。經過重重推理,雲弘深和聞夜鳴順利逃出密室,卻發現教官章華帶領眾學員等著他們,原來這是一次針對他們兩人的演習,可云弘深和聞夜鳴能察覺到是有人想假借這次機會,除掉他們,最終目的還是從雲弘深那裡找到密碼本。聞夜鳴發電報告訴柯靖平“已經確認了目標,明天動手”,而這條電報被人監聽到,並傳遞給了宗方,聞夜鳴回宿舍的路上,她看到了鬼鬼祟祟的教官騰平。
雲弘深已經推測出了章華的計策,原來是章華給匕首塗的毒,利用騰平喜歡聞夜鳴,見到聞夜鳴跟雲弘深關係密切一定會嫉妒,並跟雲弘深產生矛盾,想藉騰平之手除掉雲弘深,而且靳國強的死也是章華一手策劃的,他利用送補給的貨車司機錢大海酗酒,趁錢大海要出城送貨時,讓騰平給貨車司機送好酒,他猜到錢大海一定會忍不住喝酒,就半路攔截要搭順風車,以錢大海喝酒為由,讓他去副駕駛,自己開車撞死了靳國強,偽造了錢大海酒駕導致車禍的假象。這一切,都被雲弘深攜帶的竊聽器傳遞給聞夜鳴,聞夜鳴通過廣播,播放給了培訓基地的全體學員,章華惱羞成怒,制住了雲弘深,此刻趕來支援的凌寒闖了進來,與章華持槍對峙,狙擊手擔心凌寒的安危,開槍打死了章華。回到軍統情報站,柯靖平聽完匯報大怒,而此時薛長官也給柯靖平施壓,柯靖平讓幾人盡快查找更多線索,找回密鑰。雲弘深回到家中,雲弘祈跟雲弘深分享了自己查李妙涵的成果,查到李妙涵與其他抽賓治雪茄的男人都有不正當關係,其中竟然有曲文摯,雲弘深認為李妙涵很關鍵,要嚴密調查。
被米蘭拒絕後,隔天吃飯時,雲弘祈還回想米蘭說的話,無意識說出自己也不希望是雲家大少爺的話,被奶奶聽到,雲老夫人傷心至極,雲弘祈也意識到自己說錯了話,十分後悔。雲弘深給了聞夜鳴一張路線圖,讓聞夜鳴重新走一遍在雲家當晚伏擊失敗的路線,聞夜鳴走了一遍,發現了蹊蹺,原來當晚是兩人來雲家,腿部受傷的並非軍統內部人員,這也證明了為什麼軍統內部沒有人左腿受傷,而腿部受傷正式潛藏在長沙的宗方的手下的曹元。聞夜鳴向柯靖平匯報了雲弘深對李妙涵身份的猜測,柯靖平命令聞夜鳴嚴密監視李妙涵,聞夜鳴接柯靖平指令跟踪李妙涵,但一無所獲。記錄下她所有見過的人,另一邊雲弘深跟蹤者朱副站長的一舉一動。雲弘深調查章華的資料,提出章華可能是日本間諜的消息,他的消息管道引起凌寒和朱賀的注意,柯靖平也讓聞夜鳴試探雲弘深。雲弘深的行動被許年嚴密監控,許年把掌握得雲弘深的行動交給了朱賀,而這一次都在雲弘深的計算之下,他在跟踪朱賀的路上,意外發現了凌寒也在追蹤調查朱賀。
雲弘祈和小刀潛入到白慶奎的辦公室,找到了他私自記錄的帳本,查到了白門送出曲文摯的那條記錄。為了引出川島,雲弘深經過宗方搭橋牽線,約李妙涵一起吃飯,當晚李妙涵與宗方準時赴約,雲弘深帶著米蘭在餐桌上與他們侃侃而談,聞夜鳴則在暗處,隨時觀察附近的動向。飯畢,雲弘深送宗方和李妙涵出門,看到了藏在暗處的川島,聞夜鳴也發現了川島,川島趕忙逃跑,聞夜鳴當即驅車去追,雲弘深也剛要去追,米蘭卻差點發生車禍,嚇暈了過去,雲弘深處理好昏迷的米蘭,趕緊追去幫聞夜鳴。正在巡邏的唐隊長看到了開車飛快的雲弘深,擔心雲弘深安危,讓手下們都跟上去,追踪了一路的聞夜鳴感覺到不妙,原來這竟然是宗方的埋伏,他們想引誘川島現身的同時,宗方也用川島為他們設計了陷阱,暗中讓曹元埋伏,踏入陷阱的聞夜鳴肩膀中了一槍,聽到槍聲的雲弘深慌忙趕到,救下了聞夜鳴,此時唐隊長也趕到,雲弘深讓唐隊長立刻抓捕李妙涵,並封鎖周圍,必須抓住兇手,自己送聞夜鳴去了醫院。
軍統殺手找到白慶奎藏身處,當著二姨的面殺死了白慶奎,被埋伏的特務活捉。凌寒帶著假扮的李妙涵引川島上鉤,卻被雲弘深搶先一步抓走川島。雲弘深逼問川島,川島剛說出「鬼徹」的代號,卻被狙擊手曹元一槍斃命。等凌寒趕到,只看到川島的屍體。雲弘深推測出狙擊手的位置,趕回茶樓卻發現許年受了朱賀的指派在盯著現場的假雲弘深。柯靖平得知朱賀派殺手殺了白慶奎,又盯梢雲弘深,認為朱賀有重大嫌疑,將朱賀關了起來。雲弘深凌寒討論宗方和朱賀的嫌疑,凌寒話鋒直指抓走川島的雲弘深。聞夜鳴發現凌寒派人跟著保護她,卻不為所動。到家後凌寒找上門來,聞夜鳴卻對他十分冷淡。凌寒失落離開卻被雲弘深目睹,雲弘深誤以為凌寒送聞夜鳴回來,吃醋賭氣離開。情緒不佳的雲弘深回家與雲弘祈吵了起來,兄弟倆鬧了彆扭。雲弘深卻從蛛絲馬跡中找到搶手曹元,就是街角的包子店老闆。米蘭得到了昆吾的命令,要搞清楚川島向雲弘深透露了多少。
柯靖平從朱賀案分析隱藏內鬼的身份,苗頭指向凌寒,朱賀向柯靖平坦白殺死白慶奎是避免自己走私西藥的行為曝光,雲弘深設計將吳同轉移出去,並將凌寒掉包包的子彈頭換了回來。開會時凌寒暗指雲弘深形跡可疑,並向聞夜鳴指出自己的懷疑,卻遭到了聞夜鳴的冷漠。雲弘深向聞夜鳴說明原委。凌寒審問許年,得知茶樓裡的人並不是雲弘深。凌寒搜查雲弘深辦公室,找到與自己有關的照片,凌寒銷毀照片,並向柯靖平匯報,指證雲弘深陷害朱賀是想藉刀殺人除掉內鬼為父親報仇,雲弘深被停職反省。柯靖平敲打凌寒,要他不要再跟雲弘深。雲弘深回家,雲老夫人本來想告訴雲弘深米蘭的蹊蹺,卻因雲弘深情緒不佳而未開口。昆吾敲打米蘭,告誡米蘭雲弘祈其實不信任她,她想起自己在雲老夫人面前露出的破綻,開始害怕雲老夫人告訴雲弘深會導致自己暴露。雲弘深想到了拿走密鑰的人是凌寒。
雲老夫人對米蘭起疑,因此擔心雲弘祈和米蘭的關係,請米蘭來家裡吃飯來試探。米蘭很敏銳的感受到了雲老夫人的懷疑,但還是露出了更多的破綻。二姨因為白慶奎的死,也前往雲家,想用利益說服雲家做她的靠山。雲老夫人拒絕與二姨合作,二姨被趕了出去。雲老夫人打電話尋找雲弘深,聞夜鳴猜到雲弘深會去凌寒家,前去通知雲弘深。米蘭發現自己露出了破綻,返回雲家趁無人目擊殺死了雲老夫人,雲老夫人臨死前刺破手絹試圖留下線索。二姨的保鑣叢虎被曹元殺害。雲弘深心知雲老夫人一定有急事,匆匆趕回去,卻只見到了雲老夫人的遺體。雲弘深發現了手絹的秘密,猜到兇手是米蘭。凌寒也發現了雲弘深曾經潛入自己家中。雲弘深衝動之下想找米蘭報仇,被聞夜鳴攔下,聞夜鳴表示願意替雲弘深去尋仇,雲弘深也決定為了查出昆吾先忍耐以避免打草驚蛇。聞夜鳴審問米蘭,發現了疑點,米蘭卻故作無辜。聞夜鳴決心查清米蘭的身份。
二姨有殺雲老夫人的嫌疑,逍遙居要被軍統關閉,二姨為了保住白慶奎的心血,拿唐太太入股逍遙居藥店的事要挾,要唐隊長幫忙。唐太太得知逍遙居有送走曲文摯的大罪,明白自己在劫難逃。雲弘因為雲老夫人過世而神情恍惚,雲弘深告訴楊梓銘米蘭就是兇手,楊梓銘很驚訝,並提醒雲弘深不可輕舉妄動,雲弘深正式向楊梓銘申請入黨,楊梓銘欣然接受,願做他的介紹人。米蘭到雲家弔唁老夫人,楊梓銘和雲弘深為了避免雲弘祈用情太深,告訴雲弘祈米蘭是兇手,雲弘祈大受打擊瀕臨崩潰。凌寒發現雲弘深調查自己,向戴笠舉報雲慕之是地下黨。唐太太被唐隊長質問是否私下跟二姨有勾結,唐太太矢口否認,卻似乎下定了什麼決心。宗方建議米蘭暫時不要有動作,雲老夫人的死會讓軍統有大動作,日諜網路有被大舉取締的風險。雲弘祈晚上被惡夢驚醒,想要去找米蘭尋仇,雲弘深勸住悲憤的雲弘祈後,獨自去探查米蘭住處,險些被發現。
雲弘深、楊梓銘等人將雲老夫人安葬之後,被楊梓銘送去安全點休養。聞夜鳴開始調查虎姘頭被殺案,卻在現場碰到二姨,二姨努力剖白自己,撇清殺害雲老太太的嫌疑。唐太太為了洗清唐隊長的嫌疑,前去逍遙居去二姨公開撕破臉,並在二姨面前舉刀自盡。雲弘深暗中囑咐吳同的老婆不要透露他們溝通的事,擔保吳同能獲得自由,而米蘭正在被聞夜鳴步步緊逼,扒出她身份信息中的破綻。晚上聞夜鳴到雲家,卻沒有等到雲弘深,雲弘深此時還在米蘭住處附近盯梢,跟蹤米蘭時也不防背後也有人在盯著自己。米蘭並沒有等到接頭的電話,回到住處開始細查之前的畫信。二姨沒想到唐太太性子如此決絕,心知逍遙居保不住了,也在白慶奎靈前服毒自盡。唐隊長將孩子託付給組織,一心一意投入對日的鬥爭。雲弘祈在休養處得到黨組織前輩的開導。楊梓銘將唐隊長的家人送去根據地。楊梓銘接到電話,說上海儲備金小組出事,唯一倖存者張顯成將來到長沙,楊梓銘指示唐隊長去接應。雲弘深告訴唐隊長曹元是殺叢虎的兇手,唐隊長去查曹元,曹元向宗方米蘭示警。
徐偉華向朱賀說出凌寒讓他跟蹤雲弘深。米蘭在電話亭通知凌寒撤離,雲弘深趕到電話亭,卻被米蘭暗中拍下照片。柯靖平監聽到米蘭給凌寒的電話,凌寒被抓,凌寒為了證明清白,交出了他監聽的一個日本電台;雲弘深和朱賀密會時想到柯靖平一定會派聞夜鳴去查辦,為了保護聞夜鳴,他推斷出凌寒電台的位置並前去和聞夜鳴並肩作戰,兩人在地下電台互訴衷腸,表白感情,之後聞夜鳴依然堅持完成任務,雲弘深決定留下守護。凌寒無意間傳遞訊息出去,柯靖平警覺發現,但日諜收到消息紛紛消失,柯靖平想一網打盡卻撲了空。雲弘深和聞夜鳴收到了凌寒電台的電文,說日諜「先生」將到長沙,會帶來新的日本潛伏人員名單。宗方和米蘭接頭準備接應「先生」。柯靖平兵分兩路,抓凌寒供出的電台,同時碼頭抓先生,先生和張顯成同在一艘船上。軍統和日諜都在碼頭布下眼線,靜待先生的船到港。
日諜在中山碼頭故意製造混亂,日諜電台同時被另一路軍統人員端掉,聞夜鳴指揮軍統眼線與日諜激戰。輪船到港,狙擊手打傷唐隊長引發恐慌。雲弘深帶領軍統特工上船抓先生,聞夜鳴在岸上指揮抓捕製造混亂的可疑人員,曹元被擊斃,他口袋裡搜出雲弘深照片。船上的日諜眼線抓了孩子當人質,雲弘深前去救援,險些被日諜打中,張顯成及時趕來,為救雲弘深犧牲,並留給雲弘深一句暗語,雲弘深不明所以,但是對張顯成的身份有些懷疑。雲弘深抓住了代號先生的日諜,是一對雙胞胎姊妹,卻得罪了同船的軍統特派員施長生。唐隊長向聯絡點傳遞訊息,說張顯成已經遇害。聞夜鳴在碼頭發現了宗方,追捕宗方未果。米蘭打電話給報社引來記者污衊軍統槍殺平民,軍統將碼頭上埋伏的宗方線上的日諜全部消滅。唐隊長透過地下黨聯絡點緻雅居向楊梓銘報告張顯成犧牲;因凌寒舉報雲慕之是地下黨,戴笠派來施長生調查雲弘深的共黨嫌疑。米蘭得知先生落在雲弘深手裡,安排日諜消滅先生以免情報洩露,雲弘深安排人假扮先生出港,港口陷入混戰。
雲弘深向特派員施長生解釋自己的做法,得到施長生的欣賞和認可,船上的廚師要刺殺雙胞胎姊妹,被雲弘深和特務擊斃。而另一位日諜扮做服務生瞞過特工,從上方甲板將先生殺死,雲弘深和聞夜鳴及時找到了先生攜帶的名單。楊梓銘接到張顯成犧牲後,在極力思考之前雲慕之策劃的對日多金行動紕漏。軍統依照名單抓住所有新派遣來的日諜,凌寒立功,洗脫嫌疑,卻看到聞夜鳴和雲弘深的親密情形,心生嫉妒;軍統審問季方的未婚妻,宗方藏身處,卻沒有抓到宗方本人。楊梓銘得知張顯成留了一句話給雲弘深,決定去見雲弘深,搞清楚上海儲備金出了什麼事;雲弘深得罪了戴笠派來的施長生,受柯靖平處分;雲弘深檢查張顯成的行李箱,懷疑張顯成的身份。楊梓銘要驚雨給雲弘深打電話,要見雲弘深,從張顯成的話里分析出儲備金小組裡出了叛徒,而云慕之的身份有可能暴露。讓雲弘深離開去雲弘祈養病的地方避險;聞夜鳴讓碼頭鬧事記者聽米蘭的聲音,確認米蘭也在碼頭上。
施長生要押雲弘深去重慶坐實其地下黨身份,並要柯靖平調查楊梓銘,凌寒設計讓柯靖平拿到雲弘深打電話的照片,讓人以為是雲弘深冒充米蘭給凌寒打電話,意圖陷害雲弘深是內姦;聞夜鳴不相信雲弘深是共黨,柯靖平嚴令聞夜鳴查實雲弘深的共黨身份,但聞夜鳴決心幫雲弘深洗脫嫌疑;凌寒卻找柯靖平,帶著女傭驚雨的電話錄音,說服柯靖平對雲弘深實施抓捕。楊梓銘前往休養處探望雲弘深,卻發現雲弘深沒有去藏身點,十分擔憂。
雲弘祈發現楊梓銘來安全站,判斷雲弘深有危險,決定回長沙;楊梓銘決定犧牲自己來引開軍統火力,保住雲弘深,他讓緻雅居的同事轉移去上海查儲備金的事;雲弘深見聞夜鳴,得知自己被拍下打電話的照片,使軍統以為是他給凌寒打的電話誣打陷凌寒;雲弘深從聞夜鳴提供的照片判斷出了米蘭的安全屋,故意驚動米蘭,誘導米蘭通知凌寒和宗方見面,準備將其一網打盡;凌寒潛入雲家放偽證誣陷雲弘深是共黨的人,被驚雨發現,凌寒殺死驚雨;楊梓銘故意在緻雅居留下指向自己的證據。
雲弘深將密碼本藏在楊梓銘家;米蘭發信號和凌寒、宗方見面,凌寒卻認為發信的人是雲弘深,雲弘深跟踪米蘭想一網打盡,雲弘祈找聞夜鳴施壓,卻意外得知聞夜鳴與雲弘深的戀人關係,從而放心聞夜鳴的善意。聞夜鳴找柯靖平給凌寒的嫌疑,柯靖平不予採信,但朱賀已經暗自決定盡量與雲弘深站一隊對付凌寒。
另一邊雲弘深卻被凌寒反設計,雲弘深被軍統抓獲。柯靖平不允許聞夜鳴與雲弘深見面,但許可聞夜鳴繼續查凌寒。楊梓銘讓吳秘書找到雲弘祈,讓雲弘祈組織群眾阻止施長生將雲弘深帶回南京。柯靖平和聞夜鳴的談話被徐弼竊聽,徐弼將一個可疑的電話給了龔士儀,龔士儀查到給雲弘深打電話的是楊梓銘。凌寒和龔士儀在緻雅居發現了我黨的電台和楊梓銘了留下的痕跡,隨後又在雲弘深家裡發現了凌寒之前放進去的紅色剪報。凌寒和龔士儀向柯靖平報告楊梓銘和雲弘深都是共黨。
雲弘祈搬來記者和學生遊行隊伍抗議軍統無證據抓雲弘深;施長生收到上峰來電,告知柯靖平雲家與宋美齡有舊誼,讓柯靖平先放了雲弘深,並抓緊坐實其共黨身份,柯靖平向施長生報告凌寒的嫌疑;雲弘深和雲弘祈透過施壓要帶走驚雨的遺體回到雲家。凌寒查張顯成留給雲弘深的話,全力要證明雲弘深的共黨嫌疑;徐弼竊聽凌寒,發現他有誘供嫌疑,併報給朱賀,龔士儀外出致電王公館,給出暗號顯示其有可能是地下黨身分。為了救雲弘深出水火,雲弘祈和聞夜鳴聯手,雲弘祈發動人脈尋找宗方的下落,楊梓銘被監視,雲弘深想故意洗清楊梓銘的嫌疑,被楊阻止,但云弘深卻決意救助楊梓銘。而聞夜鳴則到處尋訪檔案資料核實米蘭的身份,龔士儀卻提醒柯靖平楊梓銘可能不是共黨。
聞夜鳴終於查清米蘭的身份是假冒的,聞夜鳴查到了米蘭和宗方的藏身之處,雲弘祈也同時查到了米蘭和宗方,雲弘祈和米蘭狹路相逢,做最後的決裂,宗方和米蘭逃脫。柯靖平和雲弘深對質,質問他和楊梓銘的關係,拿出紅色剪報讓雲弘深解釋,雲弘深卻透過報紙推斷出了殺死驚雨的就是凌寒。
同時楊梓銘再次嚴詞拒絕雲弘深的救助,施長生繼續向柯靖平施壓,要求他做好楊梓銘和雲弘深的處理問題。柯靖平繼續和楊梓銘對峙,告訴他緻雅居的電文已經被破譯,要楊梓銘自己坦白到底是中統還是陳立夫的人。楊梓銘保持沉默,為了儲備金計畫的安全,他決定犧牲自己讓軍統死無對證。楊梓銘用口琴向外面的吳秘書傳遞了情報,然後故意挾持雲弘深,迫使軍統擊斃他,也幫雲弘深洗清了共黨嫌疑;吳秘書被抓,證實了楊梓銘是重慶的高級特工,柯靖平等人騎虎難下,只好暗中放了吳秘書;聞夜鳴查到了米蘭的真實身份,讓柯靖平相信凌寒是日諜,柯靖平和雲弘深在楊梓銘墓前談心,雲弘深告訴柯靖平米蘭是鬼徹,而凌寒有可能就是昆吾。
凌寒跟蹤雲弘深被發現,施長生返回重慶前囑咐柯靖平隱密處理凌寒問題,柯靖平意識到凌寒已經在上峰心目中失去地位。吳秘書也成了被秘密處決的對象,龔士儀帶隊處決,卻被唐隊長和老黑救走了吳秘書,脫身的吳秘書作為聯繫人告訴雲弘深正式入黨了,並告知雲弘深凌寒的真實身世。雲弘深在軍統情報會議上,通報米蘭是日本特工鬼徹,聞夜鳴也佐證米蘭偽造身份的證據,從而綜合線索推斷凌寒是鬼徹的上線,同時宗方的踪跡被發現,柯靖平下令抓捕凌寒和宗方,柯靖平已經決定讓凌寒殉職以避免他的日諜身份帶來的政治風險。抓捕宗方過程中軍統和日本人發生激戰,雲弘深意識到中了日本人圈套。凌寒此時透過楊梓銘的遺言,在麓山寺尋找密碼本,而米蘭宗方手下的日諜已經被雲弘深帶隊掃平。
柯靖平派龔士儀去抓凌寒,卻被凌寒逃脫;米蘭也帶著日諜跟蹤凌寒,她得知凌寒並未拿到密碼本,派日諜盯著雲弘深,想找到密碼本的下落。雲弘深告訴聞夜鳴柯靖平也有另一面,卻終究不忍心將自己的判斷全盤告知。柯靖平推測雲弘深藏密碼本的過程,雲弘深心中驚異柯靖平對自己如此了解。柯靖平將放密碼本的保險箱的兩把鑰匙給了雲弘深和聞夜鳴分別保管;凌寒綁架了朱賀,米蘭綁架了收容所的老師孩子,要引出雲弘深和聞夜鳴,拿到保險箱鑰匙;雲弘深和聞夜鳴為保人質安全,分別被米蘭和宗方綁架,和朱賀一起被關在宗方的安全房。凌寒和米蘭宗方一同出現,並推測出來密碼本的藏匿地點,柯靖平收到凌寒是日裔的證據,而凌寒已經押著雲弘深和聞夜鳴去尋找保險箱的路上。
雲弘深聞夜鳴及時脫身,趕往保險箱所在的教堂。帶上武器截住押送朱賀的宗方,救出朱賀,另一邊柯靖平已經在可能抓獲日諜的地點安排下天羅地網,凌寒和米蘭、宗方兵分兩路打配合欲奪取密碼本,米蘭和宗方在碼頭轉移軍統注意力,其他日諜製造混亂,便於凌寒去教堂拿密碼本的保險箱,而柯靖平已經親自坐鎮教堂。聞夜鳴和雲弘祈在碼頭對付宗方等人,卻發現了許多假冒凌寒的日諜,聞夜鳴判斷凌寒不會來火車站,肯定是去了教堂。日諜發動攻擊,聞夜鳴配合雲弘祈演戲給米蘭,幫雲弘祈受了輕傷,與放鬆警惕的日諜展開激戰,還是被米蘭和宗方逃離。凌寒晚上去教堂,落入了柯靖平和雲弘深的圈套,凌寒被龔士儀擊斃,死前雲弘深告訴凌寒他其實是中國人,所謂私生子不過是宗方編出來讓他就範的藉口。凌寒痛苦萬分,他臨死前告訴雲弘深密鑰藏匿處的暗語,雲弘深明白了凌寒的用意。柯靖平將密碼本放在自己辦公室休息室的保險箱裡。雲弘深已對柯靖平有所懷疑,但沒敢告訴聞夜鳴。柯靖平為雲弘深定了三天期限,要他查到金鑰的下落。
雲弘深查到凌寒在盛興旅社給他留了線索,從凌寒臨死之言中分析出密鑰是一本《鏡花緣》並找吳秘書破譯出情報,分析出日軍偷襲長沙的進軍方向。並向吳秘書和盤托出懷疑柯靖平就是昆吾,但雲弘深卻根據之前米蘭等人的表現懷疑日軍的進軍情報是假的。雲弘深發現情報是戰略欺騙,並和吳秘書一同分析出柯靖平在軍統湖南情報站裡有對日的秘密電台,雲弘深決定去一探究竟。柯靖平和米蘭見面,說雲弘深已經開始懷疑他,要犧牲米蘭來證明自己不是昆吾,米蘭決心為天皇效忠,啟動玉碎計劃;雲弘深找到凌寒留下密碼箱,並且破譯出了密碼,他從密碼箱裡拿到了宗方的身份說明以及柯靖平密室的圖紙,雲弘深這才知道柯靖平的辦公室裡有一個密室,雲弘深決定去一探究竟,查明柯靖平的真實身份。
雲弘深撞破米蘭挾持柯靖平,對峙中朱賀趕來,情急之下打死米蘭,雲弘深心知因此會被敵人牽著鼻子走,也無可奈何。龔士儀在日諜的據點裡發現了火藥,柯靖平讓龔士儀查宗方的任務。聞夜鳴重傷住院,雲弘深心疼萬分前去望,雲弘深說出對柯靖平的懷疑,聞夜鳴難以接受。宗方的蹤跡顯現,龔士儀查到宗方最後的任務是搞一次大爆炸,雲弘深明白柯靖平要利用宗方搞爆炸來逼迫自己找到密鑰,但是如果柯靖平得到密鑰,則假情報很快就會被送到薛岳手中,國軍在戰場上就會判斷失誤。雲弘深陷入兩難,他想傳遞訊息給雲弘祈,卻被龔士儀盯著難以行動,龔士儀從柯靖平的部署中明白自己應緊盯雲弘深,並且也發現雲弘深很多不對勁的地方。朱賀從查到的線索中知道宗方目前對一些藥物的需求,柯靖平要求嚴密布控,把炸藥和宗方一起找出來,行動還是由雲弘深和龔士儀一同負責,雲弘深依然需要想方設法向外傳遞消息。
龔士儀因為沒抓到宗方加劇了對雲弘深的懷疑,將自己的看法報告柯靖平。雲弘深為了解開心中的謎團,查找了凌寒在圖書館借閱過的所有資料,推斷出凌寒當時也在查探柯靖平的身份,同時發現少了一份地下管道圖紙。雲弘深意識到宗方的任務是要透過地下管線實施瓦斯爆炸,聞夜鳴提出米蘭所在的傷兵醫院有可能是藏匿炸藥處,雲弘深和唐隊長一起找到了炸藥,雲弘深帶著軍統的人找到宗方,宗方被軍統擊斃,臨死前他告訴雲弘深,他是找不到密鑰的。而唐隊長在擊斃宗方時展現的槍法,讓龔士儀感到疑惑。柯靖平讓雲弘深等人繼續追查密鑰的下落,並破天荒的邀請雲弘深去探望夜鳴。雲弘深推辭,柯靖平一個人離開辦公室去醫院。雲弘深進入柯靖平的休息室,打開保險箱,找到了按鈕打開了密室,發現了密室裡的日諜計畫的資料,終於確定了柯靖平是昆吾。而雲弘深的行動都被暗處的一雙眼睛監視著。雲弘深調查完畢回到家中,看到雲弘祈強顏歡笑的樣子感到心疼,但還是告訴他米蘭的死訊。
雲弘祈知道米蘭死訊後癲狂大笑,當得知米蘭死時帶著自己送的胸針,笑容瞬間消失,來到雲老夫人的靈位前祭告兇手已死。昆吾已經向日軍司令部發信,確定日軍的進軍路線。而雲弘深決定不惜犧牲自己,也要阻止昆吾柯靖平的計畫。明面上依然在軍統站內跟柯靖平虛與委蛇,討論尋找密鑰的方法,過程中雲弘深找到了密鑰就藏在自己家。柯靖平仍派龔士儀盯著雲弘深去取密鑰,龔士儀和雲弘深在雲家找到了宗方的蹤跡,找到了密鑰,果然是鏡花緣。柯靖平一邊派雲弘深去取密鑰,一邊將雲弘深找到並破譯好的密碼本交給了薛岳的副官,並請其親自破譯,內容顯示日軍的僅供方向,被副官帶回指揮部。副官臨走時被雲弘深叫住,並指出這密碼本是假的,當場揭發了柯靖平是昆吾的身份,薛岳副官和軍統眾人都不知誰真誰假,在當場眾人的見證下一起進入密室,卻發現柯靖平的密室已經被偽裝改換,沒了昆吾的蹤跡。柯靖平把雲弘祈和聞夜鳴都找到軍統站來,但是雲弘祈讓手下及時通知了吳秘書。
程惠澤也站出來證明雲慕之沒死,連同柯靖平一起製造出了雲弘深才是日本間諜的「事實」。雲弘深竟然承認了雲慕之還活著,似乎承認了自己被日本人以雲慕之做要挾當了漢姦。雲弘深被逮捕入獄,薛岳下令查清所有事情之前不能讓雲弘深死去。吳秘書上門告知憤怒的雲弘祈,雲弘深並不是漢姦,一切都是雲弘深以自己為死棋所佈的局。聞夜鳴約見雲弘祈,告訴他自己選擇站在雲弘深一邊,兩人決定去找證明雲弘深清白的證據。雲弘祈找到吳秘書商量對策,吳秘書認為雲弘深暫時沒有生命危險,他提出想辦法在柯靖平密室安裝竊聽器。朱賀也發現了柯靖平的說辭有破綻,對柯靖平的論調存疑,並找到雲弘深留給他的調查線索。聞夜鳴和雲弘祈聯手吸引柯靖平的注意力,吳秘書起用暗線徐弼在柯靖平密室裡裝監聽。柯靖平在密室單獨審問雲弘深,要雲弘深認罪,卻被雲弘深設計親口承認了自己是昆吾,並且透過監聽被朱賀傳給了薛岳和所有人,柯靖平因此暴露被殺。雲弘深立功受到軍方高層接見,卻發現國軍高層裡也有父親的同志。第一次長沙會戰打響,日軍失敗,中國取得了重大勝利。