《南風知我意》的大結局是充滿情感糾葛和轉折的。傅雲深在經歷了一系列的挑戰和困難後，最終繼承了家族產業，並與朱舊破鏡重圓，生下了女兒傅南星。而他的兄弟傅西洲因犯下重罪自首入獄五年。傅雲深原本對家族產業和權力不感興趣，只專注於藥物研究，但命運的轉折讓他回到了家族事務。在經歷車禍和雙腿殘疾後，他重新站了起來，恢復了曾經的光彩，並與朱舊風光大婚。
