《墜落JK與廢人老師第二課》講述了死氣沉沉、嗜賭如命的「廢人教師」灰葉仁和成績優秀的消極女高中生落合扇言之間的關係。在屋頂相遇1年後，經過在學校的課題和彼此的生日被吸引的兩人的“原點”被揭開。