《三大隊》開頭描寫了一起殘忍的奸殺案，受害女孩年僅十四歲，雖未喪命但卻成為植物人。為了追捕兇手，三大隊犧牲了自己的前程。大家都非常好奇三大隊會有怎樣的結局。程兵（由張譯飾演）是電影的主人公，故事主要圍繞著他展開，他全力追兇。三大隊接到報警後趕往案發現場，但來得太晚了，兩名兇手已對女孩進行了強姦，令人憤慨。

隨後，三大隊逮捕了其中一名嫌犯王大勇，而另一名逃犯則是他的弟弟王二勇，兄弟倆合謀犯案。為了得知王二勇的下落，三大隊動手對王大勇，結果導致其死亡，三大隊的成員被判入獄，王二勇依然逍遙法外。現在讓我們來看看《三大隊》中每個角色的結局吧。

張青良（楊新鳴飾）為了追兇不惜付出一切，最後在家中過世。雖然他聲稱是王二勇將其傷害致死，但未能確認是否因公犧牲。程兵出獄後堅持追尋王二勇，最終將其擒獲，完成了三大隊的任務。

老蔡（曹炳琨飾）也是三大隊的成員之一，出獄後離開家鄉，靠著賣旅遊紀念品維持生計。他害怕遇到熟人，回憶起不堪的過去。然而，他願意跟隨程兵追兇。馬振坤（王驍飾）出獄後開了一家小吃攤，幸運地遇到了一位不離不棄的妻子。老廖（張子賢飾）帶著兒子買保險，他不想捲入警方的事務，只希望兒子能有更好的前途。而徐一舟（魏晨飾）是年輕警察的代表，為人正直。他在潛伏多年後，一直在磨練自己的耐心。

追兇的五人組陸續退出追兇隊伍，老馬第一個退出，因為他不想讓女兒再受傷。老廖是第二個退出，小徐在遇到愛情後第三個離開。老蔡罹患胃癌不得不離開，只有程兵堅守到最後。