52赫茲的鯨魚是指在其他鯨魚聽不到的高頻率鳴叫的世界上只有一隻鯨魚。什麼也傳達不到，什麼也傳達不到。因此被認為是這個世界上最孤獨的。

被家人剝削自己人生的女性·貴島和被母親虐待的被稱為「蟲」的少年。因為孤獨而渴望愛，被背叛的他們相遇，誕生了新的靈魂故事－。